CEAZA incorpora tecnología de secuenciación genómica para impulsar una agricultura más resiliente a la sequía
El Centro Científico CEAZA incorporó un sistema de secuenciación genómica de alto rendimiento que permitirá avanzar en la identificación de microorganismos capaces de ayudar a los cultivos a mantener su rendimiento bajo condiciones de déficit hídrico.
La iniciativa se desarrolla mediante el Proyecto Anillo GEM-PGPR (ATE250038), financiado por la Agencia Nacional de Investigación y Desarrollo (ANID), que estudia la relación entre las variedades tradicionales de tomate, el ambiente y los microorganismos presentes en sus raíces.
El objetivo es comprender cómo estas comunidades bacterianas pueden contribuir a que las plantas enfrenten de mejor manera la falta de agua.
Tecnología de última generación
Para avanzar en esta investigación, CEAZA incorporó a sus laboratorios un secuenciador Oxford Nanopore PromethION, plataforma que permite analizar el ADN completo de plantas, comunidades bacterianas y bacterias aisladas.
Según explicó el investigador de CEAZA, Dr. Máximo González, la secuenciación genómica permitirá comprender con mayor precisión cómo los microorganismos ayudan a las plantas a adaptarse a condiciones de escasez hídrica.
La tecnología también permite trabajar con fragmentos largos de ADN, facilitando la reconstrucción de genomas bacterianos y acelerando los procesos de análisis bioinformático.
El tomate como modelo de investigación
El proyecto estudia variedades tradicionales de tomate para identificar aquellas plantas que presentan una mayor tolerancia al déficit hídrico.
El siguiente paso contempla aislar y caracterizar bacterias capaces de mejorar el desempeño de las plantas bajo condiciones de sequía.
La investigación proyecta obtener al menos 400 aislados bacterianos, cuyos genomas serán secuenciados para buscar genes asociados con la promoción del crecimiento vegetal bajo escasez de agua.
Posteriormente, herramientas bioinformáticas permitirán seleccionar las cepas más prometedoras y descartar aquellas que puedan presentar características patogénicas. Las candidatas seleccionadas serán sometidas a pruebas bioquímicas y ensayos en macetas.
Una tecnología que podría ir más allá del tomate
Uno de los aspectos relevantes de la incorporación del equipo es que su utilización no quedará limitada al estudio del tomate.
CEAZA señala que disponer de esta capacidad tecnológica directamente en la Región de Coquimbo permitirá reducir la necesidad de enviar muestras fuera de la zona y disminuir los tiempos asociados a los análisis genómicos.
La plataforma también podrá utilizarse para investigar otros cultivos, microorganismos y muestras ambientales, incluyendo organismos aislados en zonas del desierto de Atacama.
La iniciativa reúne a CEAZA, INIA La Platina y la Universidad Católica del Norte, con el propósito de generar conocimiento y herramientas que puedan ser transferidas hacia una agricultura más sustentable y adaptada a las condiciones climáticas del territorio.
